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凱米颱風在中南部造成嚴重淹水災情，行政院將治水列為優先項目。行政院長卓榮泰12日主持「系統性治水」會議，就系統性治水、災後復建做法，以及凱米颱風後續相關檢討進行討論。相關人士今天(13日)表示，卓榮泰在會中裁示，將優化法規、制度、執行面，全面提升承洪韌性，加強災前預警、災中保護、災後迅速復原，持續提升防災韌性。
政院人士表示，凱米颱風夾帶驚人雨勢，部分地區於颱風期間累積雨量甚至大於莫拉克颱風，不過淹水面積已大幅減少，展現中央和地方合作長年推動治水的成效。卓榮泰在會中表示，前瞻計畫治理已有成效，因應極端氣候仍須持續推動，中央會主動協助地方政府，地方政府也應積極配合。
政院人士表示，政院透過移緩濟急的方式，支應地方重建所需經費，未來政府也會汲取經驗，提出更好的改善方法，持續精進全台治水工程。在災後復原工作部分，將建立持久有效的復建工程，朝原災區不重複致災、鄰近災區不被殃及的方向邁進。
另外，各部會也在會中報告，因應氣候變遷，未來治水政策思維應透過逕流分擔、出流管制、在地滯洪三方面，提升土地「承洪韌性」及「流域調適」。在治山防災、水土保持、農田，及水產養殖排水方面，應持續進行流域整體治水，並進行全區整體檢討規劃，改善影響洪水及阻礙水流之相關設施。
