為扶植新創與中小企業，立委建議中小企業營所稅率維持17%，不要調高至20%。財政部表示，中小企業多採書審方式申報營所稅，且租稅優惠相當多，若再維持17%，有違租稅公平。
立法院財政委員會2日初審稅改草案，立法院在野黨團與部分立委也提出稅改版本，其中中國國民黨黨團、國民黨立委曾銘宗、民主進步黨立委余宛如的提案版本，皆建議中小企業維持17%營所稅率，認為可扶植新創與中小企業。
不過，財政部長許虞哲在立院財委會答詢時表示，營所稅是以企業的營利所得高低為計稅基礎，而非以規模大小為依據。此外，根據中小企業發展條例的認定標準，當中不乏有營業額高達新台幣數百億元、應納稅額數億元的績優企業，若給予適用較低稅率，有違租稅公平，也損及政府稅收。
財政部政務次長蘇建榮受訪也指出，台灣中小企業多採書審方式申報營所稅，符合條件(年營業額在新台幣3千萬元以下)的營利事業，更可用擴大書審純益率來計算營所稅；即便無法提供帳冊或資料不齊，也是用同業利潤標準來計算所得額，所推計出的營利所得往往偏低，繳納營所稅也偏低，再讓中小企業維持17%稅率，其實不合理。
此外，財政部官員指出，現行針對中小企業的租稅優惠已經很多，例如中小企業研究發展支出投資抵減，增僱員工薪資費用可加成減除，且以享有所有權的智慧財產權作價入股可緩課所得稅等，已考量到中小企業的發展。