台大校長遴選爭議延燒多時，教育部在27日晚間宣布駁回管中閔為台大校長的聘任案。蔡英文總統今天(28日)被問到此事時，表示尊重教育部的專業決定。

教育部27日晚間宣布駁回台大遴選委員會選出管中閔為台大校長的聘任案，要求退回台大遴委會，重啟遴選程序。
教育部此舉引發諸多批評，被質疑是項政治決定，甚至懷疑是高層授意。蔡英文總統28日在高雄參訪石安牧場，在受訪時被問到此事，總統表示尊重教育部的專業決定。總統：『(原音)這件事情我們還是尊重教育部的決定，畢竟它是一個蠻專業的決定，由教育部來做處理，我們也應該尊重教育部的決定。教育部在處理的過程中也有跨部會的協助。』
教育部是在27日晚間由次長林騰蛟召開記者會，表示在詳細檢視此次台大校長遴選過程後，認為遴委會委員及被推薦人有經濟法律上重大利益未迴避的適法疑慮，且出現明顯違背學術誠信規範的情況，有行政上的瑕疵，因此退回，要求重新檢視相關被推薦人與遴選委員的利害關係，並進行完整推薦與遴選作業程序，再依程序報教育部。