為了落實原住民族自治精神，內政部已和全國地方政府達成共識，將修改「地方制度法」，恢復直轄市原住民區選舉自治，希望趕在明年底「七合一」選舉時實施。縣市合併改制，不但直接衝擊原住民自治，也讓原住民特質不斷流失，唯有早日完成「原住民族自治法」立法，儘快落實原住民自治，才是正本清源之道。
◎6都升格 原鄉降格
2010年縣市合併改制後，6都轄內的原住民「鄉」成為原住民「區」，喪失原先具有的公法人地位，區長也由原本的民選改為官派。原住民批評縣市合併升格，卻進一步弱化、兼併原住民族，這已違反「原住民族基本法」及憲法保障的參政權，更違反兩公約及聯合國原住民族權利宣言，所保障民族自決及民族生存資源權的規定。
為此，原住民團體多次出面抗議，要求修改「地方制度法」，在「原住民族自治法」草案完成立法前，應增訂法條，恢復直轄市原住民地區自治的權力，否則就是違法、違憲。台灣原住民族部落行動聯盟執行祕書伍杜•米將說：『(原音)原住民鄉它作為一個特別的地區，受到憲法及原住民族基本法的保障，它應該針對原住民的特殊身分及土地歷史相關緣由，應該要保障它自治的相關權力，那時候5都升格，立法院並沒有顧及到這點；之後我們做了一些訴求，也為了未來桃園升格後的復興鄉，也將失去法人資格。』
◎啟動修法 恢復原鄉自治
在原住民團體及立委們多方施壓下，這項政策已獲得行政院支持。內政部日前協調相關部會、全國直轄市及縣市政府開會並達成共識，將修改「地方制度法」，設專章規範區自治，隸屬直轄市的6個原住民區可選舉自己的區長與區代表，最快明年底「七合一」選舉時就可實施。
內政部次長蕭家淇說：『(原音)我們經過法規會討論後，還需要報行政院來做法規的審查，最後會報給立法院，我們希望整個條文必須在明年的5月之前通過、發布實施，否則的話，明年底大概來不及恢復它自治法人的地位，也就是辦理區長跟區民代表的選舉。』
蕭家淇說，內政部所提的地方制度法修正案，增列原住民自治區選舉專章，恢復區自治法人地位、區長、區代表可以選舉、擁有財政預算自主權；但基於現實考量，交通、觀光與營建仍排除自治事項，課稅、公債、統籌分配稅款也列直轄市政府統籌辦理事項。
◎都市進逼 「原」味盡失
6都升格改制，對原住民產生不小的衝擊；其中，最大的問題在於「原住民族自治法」草案尚未通過，使得原住民自治進程出現停滯。
在6都改制前，各個原住民鄉鎮依然實施地方自治，雖然地方自治在保障上不如原住民自治嚴謹，但地方自治的實施至少還確保了民主的投入與部分自主的權限。不過，6都上路後，原住民區自治可說是全面停擺。
縣市合併改制，除了直接衝擊原住民的自治政策，也改變了原住民鄉的既有特質。這些居住在「直轄市」的原住民，不會因為門牌的變更就立即享受到升格的實質好處，也不可能只因為改個門牌就搖身一變成為「都市人」；更重要的是，並非所有的原住民都希望居住在都會的家園。失去了對土地的情感與生活的連結，原住民的「原」味只會因為都市化的進逼而消失，這是所有關心原住民議題的人都不樂見的。
當然，「地方制度法」再怎麼修正，終究還是不脫地方自治的層級，唯有早日完成「原住民族自治法」立法，儘快實現原住民族自治，才是正本清源之道，這也才是6都改制對原住民議題的最大啟示。