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監察院長陳菊上任後，宣布成立監察院與司法院的「院際聯繫小組」，但遭在野黨質疑逾越職權。監察院10日發出新聞稿表示，監察院與司法院聯繫平台由來已久，監察院這次成立院際聯繫小組，是延續歷來院際聯繫的經驗傳承。之前聯繫機制都是以兩院副秘書長層級進行聯繫，本次成立「院際聯繫小組」，是以監察委員為成員，提升層級，其目的主要是使監察、司法兩院職權建立良善溝通協調管道，就兩院行政事務透過先行研議形成共識，藉此避免兩院歧異，以達到良性互動及促進行政效能。
監察院表示，他們經常須就已定讞的司法案件向司法院進行調卷，但因行政手續繁雜，致使案件時機延宕，形成民怨。在尊重司法審判獨立的前提下，基於憲政權力分立原則，監察院謹守監察與司法的分際，依法獨立行使職權，對於司法人員及司法審判案件的調查，均本於「謹慎、節制」的精神進行調查，因此，由監察委員召集成立「院際聯繫小組」，促使兩院獨立職權行使，有良善溝通聯繫管道，並不涉及憲法第44條所賦與總統的院與院間權限爭議處理權限。
