一旦完成剷除與伊斯蘭國組織掛勾的本土恐怖組織「馬巫德集團」，菲律賓總統杜特蒂平亂的下一個目標，將是菲律賓共產黨游擊隊「新人民軍」。
杜特蒂20日下午探視馬拉韋市前線反恐部隊時說，「新人民軍勢力又死灰復燃了，等這裡的戰事結束以後，等這些混蛋被剿滅以後，我們再次整軍出發，新人民軍欠我們太多了！」
根據「馬拉坎南宮廣播暨電視機構」(RTVM)上傳影音網站的影片，杜特蒂重申，「我不再想跟共產黨談判，他們殺了很多我們的軍人和警察。
菲律賓政府軍正集中力量在馬拉韋市清剿「馬巫德集團」與「阿布沙伊夫組織」的成員，戰事已持續將近2個月，雙方陣亡人數超過500人。這2個本土恐怖組織據信已於2015年向伊斯蘭國組織宣誓效忠。
為掃蕩恐怖分子，杜特蒂於5月23日宣布民答那峨島全島戒嚴，但菲律賓共產黨將此戒嚴解讀為鎮壓菲共的舉措，旗下武裝單位「新人民軍」多次暗殺士兵、偷襲政府軍哨站，並且繼續勒索地方商家。
新人民軍最近槍殺了只是到市場買菜的士兵，杜特蒂憤怒地說，「幸好我們是有法治的共和國，我必須守法，否則，我會砍光這些傢伙的頭，他們連上菜市場的人都殺！」
菲律賓共產黨成立於1968年，透過新人民軍在鄉下地區作亂多年，歷任政府與菲共的和談停停開開。
菲共創始人席森(Jose Maria Sison)是杜特蒂大學時的教授，透過這層關係，杜特蒂當選後不久又與菲共重啟和談，但雙方談判再因菲共要求釋放400多名政治犯而破裂。
即使正式談判暫停，但菲律賓政府與菲共仍維持「後門協商」，直到19日新人民軍在民答那峨島的亞拉干鎮(Arakan)偷襲總統府衛隊車隊，政府決定取消「後門協商」。
菲律賓自1986年人民革命以來，歷任總統或因相信武力並非解決叛亂之道，或因不想招惹麻煩，而未全面清剿境內安全威脅，杜特蒂顯然有另一套想法，正一步一步剷除恐怖及叛亂威脅。