1908年日據時代，台灣第一座博物館「台灣總督府博物館」，也是現在「國立台灣博物館」的前身成立了，開啟台灣與近代博物學相遇，也為台灣帶來了第一批博物學家，透過這些博物學家和他們的年代所採集研究、製作的標本或原住民族文物，台灣的自然世界得以被「發現」，並奠定台灣博物學基礎，影響深遠。
19世紀末，台灣開港通商，對外開放，許多西方人士開始進入台灣，其中不乏博物學家來台進行短期調查採集，最著名博物學家斯文豪(Robert Swinhoe)就首度將台灣雲豹、台灣黑熊、台灣水鹿等哺乳動物介紹到西方。
但對台灣動植物或原住民族進行更全面性的調查，卻是在1895年日本政權進入台灣後才開始，日本人以親身踏查的實地田野調查方式，取代西方個人式調查，逐步奠定台灣近代博物學基礎，並促成台灣第一個博物館「台灣總督府博物館」的誕生。
◎森丑之助－「台灣番界調查第一人」
森丑之助是在1895年以通譯身份隨日軍來台，開始進行廣泛的原住民社會文化風俗調查與研究，足跡踏遍台灣全島原住民區域，留下豐富的文字與攝影資料。
森丑之助後來任職台灣總督府博物館，仍持續投入原住民調查與文物蒐羅，台灣第一座博物館「國立台灣博物館」目前館藏最初的原住民文物蒐藏，幾乎都是由森丑之助所建立，其中排灣族貴族文物就極具代表性。台博館策展人李子寧說：『(原音)這幾件排灣族最具代表的這幾個祖靈柱，還有排灣族重要的陶壺，排灣族雕刻的貴族的盾，這幾件都是代表台灣排灣族貴族文化的代表，所以超過一百年了，它可以算是台灣第一批原住民的收藏。』
而森丑之助強調「親身實地」的調查風格，也反應了20世紀初期日本博物學者追求知識的傳統與典範。
◎菊池米太郎 台灣特有種鳥類發現者
菊池米太郎則是日本時代台灣最著名的動物採集者，足跡也踏遍台灣山區與離島，對於台灣鳥類分佈與習性有深刻的觀察，許多台灣特有種的鳥類發現都歸功於他，他也因擅長鳥類採集與製作標本而進入當時的台灣總督府博物館。
菊池米太郎最轟動的事蹟，就是在1906年來台時捕捉到了全世界第一隻完整的雄帝雉標本，從此聲名大噪。1918年奉總督之命捕捉帝雉獻給日本天皇。目前台博館內就有菊池米太郎獵捕製作的帝雉，距今已超過一百年。策展人李子寧說：『(原音)他奉總督之命，抓兩隻帝雉給日本天皇，他其實後來在阿里山蹲了好幾天，終於抓到一隻雄的帝雉，後來在總督陪伴下獻給天皇，因此這隻鳥從此就被叫作「帝雉」。』
◎台灣總督府博物館首任館長川上瀧彌
川上瀧彌1903年來台，任職總督府殖產局，執行並主持台灣植物調查工作，尤其是有用植物調查，包括發現台灣原產野生橡膠樹，成果豐碩。
1908年，台灣總督府博物館成立，川上瀧彌成為首任館長，以五個月時間完成佈展並開館，之後更主導推動台灣自然與人文資源的調查與標本採集；1911年川上瀧彌發起成立「台灣博物學會」，提倡台灣博物學研究，並發行「台灣博物學會會報」，該學報是日治時代博物學研究的重要期刊，對後世影響深遠。
川上瀧彌擔任館長期間，招攬了如森丑之助、菊池米太郎等人入館，對於台灣博物學發展奠定重要基礎。
◎台灣昆蟲與礦物研究先驅
台灣博物館館藏相當多台灣昆蟲標本，主要靈魂人物之一就是素木得一，他同時也是台灣「寬尾鳳蝶」的發現者之一，並推動讓「寬尾鳳蝶」被指定為「天然紀念物」，是日本時代期間唯一被指定為天然紀念物的昆蟲，因而受到全島禁補的保護。
素木得一曾擔任台灣總督府博物館學藝委員，主持昆蟲及動物的研究、展示與標本蒐藏，也曾發起全島昆蟲調查，逐步揭開台灣的昆蟲真相，貢獻相當大，被譽為是「台灣昆蟲研究先驅」。
台博館的重要礦物收藏則要歸功岡本要八郎，他被譽為「台灣礦物研究先驅」，一手創辦了總督府博物館礦物陳列室。任職博物館長達20年期間，他搜集200多種礦物標本，其中有68種是台灣首次發現的新紀錄礦物，對台灣礦物界有重要貢獻。
而岡本要八郎最重要的發現，就是「北投石」，因含有放射性元素聞名。北投石也是唯一以台灣地名命名的礦物，至今全球仍屬罕見。當年岡本要八郎採集的「北投石」目前就館藏在台博館內。
◎陳兼善 戰後首任台博館館長
二次世界大戰結束後，魚類學家陳兼善奉國民政府指派來台協助接收「台灣總督府博物館」，改稱「台灣省博物館」，之後接任館長一直到1956年。
陳兼善任職期間和學生梁潤生合作開創了博物館的魚類典藏，當中如「台灣鉤吻鮭」、「香魚」、「台灣石(魚賓)」、「台灣間爬岩鰍」都是台博館現存早期魚類標本，彌足珍貴。策展人李子寧說。『(原音)陳兼善，其實他是戰後第一任的館長，他擴充了台博館的魚類標本收藏，台灣如果沒有這些他採集到的標本，其實對台灣物種的了解其實沒有那麼完整，日本時代尤其沒有注意到魚類這一塊。』
李子寧表示，台博館是台灣最早博物館，也因此早期任職於台博館的人員，也等於是第一批投入研究台灣的博物學家，透過他們的研究、調查、採集，不只豐富了館藏內容，更為「發現」台灣的自然世界或原住民族調查奠定重要基礎，而這一群早期台灣的博物學家們，他們親自走、親自看、親自採集的田野調查方式，藉由台博館策劃的「發現台灣：重訪台灣博物學與博物學家的年代」常設展，也等於回顧了台灣博物學發展的軌跡與脈絡，也透過蒐藏品背後的故事，體現台博館在歷史過程中扮演的角色。