行政院長賴清德今天(22日)接見「第27屆醫療奉獻獎得獎人」時，表示現在愛滋病的病人主要來源已經不是針筒引起的，而是同性戀、男男同性戀之間所引起，引發歧視的質疑。賴清德隨後澄清，表示他只是分享目前的統計數字，沒有任何不敬的意思。行政院發言人徐國勇隨後也補充表示，賴清德精確的說法是指「不安全性行為」。
對此，疾管署表示，由國內的統計數字來看，近年新增的愛滋個案中，確實有8成來自男性間不安全性行為，其他2成則是異性間不安全性行為、共用針具以及垂直感染。
不過，疾管署也強調，「性傾向」與「性行為」還是有其差異，愛滋是透過不安全性行為感染，無論是同性戀或異性戀，只要有未戴保險套的不安全性行為，都有可能會感染愛滋，因此，無論「性傾向」為何，唯有安全的性行為、全程使用保險套，才能預防感染愛滋。