新任教育部長將由中央研究院院士吳茂昆出任，全國教師工會總聯合會16日由於吳茂昆過往曾有負面新聞，所以對他還要再觀察；國教行動聯盟則期盼，吳茂昆能成為「全民的教育部長」，了解12年國教及技職教育的運作，並能擺開政治壓力，妥善處理台大校長管中閔案。

中央研究院院士、國立東華大學前校長吳茂昆將接任教育部長。全國教師工會總聯合會理事長張旭政指出，他以前和吳茂昆沒有實質接觸，但由於吳茂昆曾傳出溢領學術津貼等負面報導，他擔憂吳茂昆未來在教育資源的分配或在政策的決定上，會不夠周延和透明，因此，目前還不敢講對他有什麼期望，還需要再觀察。
張旭政表示，吳茂昆上任後，首先要處理的應是管中閔案，但無論最後做出什麼決定，都很難得到眾人的認同。張旭政：『(原音)最後不管是聘任或不聘任，看來他都不會太好做，也不太可能得到大家的肯定。』
國教行動聯盟理事長王立昇則表示，吳茂昆的學術成果備受推崇，也當過大學校長，未來希望他是「全民的教育部長」，對於管中閔案能夠擺開政治操作和政治壓力，本著教育良知來處理。
王立昇也期待，吳茂昆未來能提出國教方面的看法，促使學生的學習更有效能。王立昇：『(原音)特別是技職教育這一塊，還有12年國教這塊，怎麼樣能夠了解它的運作情形來推動。』
另外，高教工會組織部主任林柏儀表示，高教工會將等吳茂昆上任有正式發言後，再進一步評論，但期盼新的教育部長能改善台灣高等教育的既有問題。