國立台灣大學今天(4日)中午發出聲明表示，對於教育部未能依大學法規定聘任新校長，再度表達遺憾與強烈異議，將遵行臨時校務會議的決議，在今天委請律師正式向教育部提出訴願，以釐清法律爭議，並捍衛學校校長遴選的自主性。
台灣大學指出，校長遴選委員會在1月5日依法選出管中閔教授為校長當選人，並於1月10日將新任校長相關證件資料，報請教育部自2月1日起聘任。然而4個多月以來，歷經諸多波折，校方雖多次與教育部公文往返說明，教育部仍於5月4日來文要求學校「應迅即重啟遴選程序」。
台大在5月12日召開臨時校務會議，會中決議「教育部應依大學法等規定，處理本校之校長遴選結果，盡速發聘」，並於5月22日依臨時校務會議決議，回文請教育部盡速致聘，回文中並具體提出，教育部應依法聘任管中閔教授為新任校長的法理依據，但教育部仍於5月24日再度回文要求重啟遴選程序。
台大強調，校方堅持大學自主的立場一貫不變，此次校長遴選的合法性，不僅遴選委員會已於1月31日的會議中決議，「本會確認 107年1月5日管教授之當選資格，並無疑義」，臨時校務會議也已明確表達教育部應該依法盡速發聘，因此將遵行臨時校務會議的決議，委請律師正式提出訴願，以釐清法律爭議。