為儘速妥適處理1021鐵路事故善後事宜，行政院政務委員陳美伶今天(22日)依照行政院長賴清德指示，前往宜蘭現場了解處理狀況，並邀集內政部、交通部、衛福部、教育部及宜蘭縣政府相關單位，在蘇澳榮總召開「1021鐵路事故善後處理事宜會議」。經與會機關代表共同研商後，決定給予每位罹難者新台幣540萬元賠償與濟助金，重傷者240萬元5千元，相關賠償金須在本週內全部發放完畢。
行政院指出，這次事件共有18位罹難者，除1位花蓮籍民眾大體已於21日運返花蓮，1位在宜蘭火化並進行海葬，另有16位台東籍民眾，將於遺體修復完畢後，依家屬意願送回台東。未來是否在台東舉行聯合公祭，由交通部偕同台東縣政府依家屬意願全力配合辦理，相關遺體運送及殯葬費用全部由交通部負責。
行政院表示，有關後續賠償事宜，依鐵路法授權法規，罹難者每位可獲賠償250萬、特別濟助金280萬及慰問金10萬元，共計540萬元；未來也將依事故鑑定後的責任歸屬做最後判定。重傷部分，每位受傷者依鐵路法賠償140萬、特別濟助金100萬及慰問金5千元，共計240萬元5千元。其他傷害依受傷程度，最高給予60萬元撫慰金，另加5千元慰問金。此外，受傷經處理即返家、未繼續住院治療者，依就醫紀錄均發給5千元慰問金。至於目前仍住院的50位傷者的所有醫療費用，包括健保部分負擔，自費給付的醫材、住院伙食費等，由交通部相關預算支應，如有不足，將協請賑災基金會專案協助。
行政院表示，針對因本次事故罹難與受傷的學生，教育部已另行致送慰問金罹難5萬元，重傷2萬，輕傷1萬；教師部分，死亡及受傷者均致送2萬元慰問金。另外，學生平安保險理賠部分，也將由教育部全力協助學生辦理。教育部並提供單一服務窗口：王志文教官，電話0920-316271。
行政院指出，為使每位受傷及罹難者家屬得到周全的關懷，政府已規劃每個家庭均由一位專責社工協助，未來如有心理諮商等癒後照顧需要，政府也將全面專案處理。另外，為協助家屬處理後續事宜，台灣鐵路管理局設有單一窗口(台灣鐵路管理局專員徐竹平，電話0937-607918；宜蘭運務段段長謝清田，電話0933-985819)，24小時提供諮詢與協助。
行政院表示，陳美伶請各相關機關務必以同理心將各項服務提供到位，相關賠償金也須在本週內全部發放完畢，希望罹難者家屬及受傷民眾早日走出陰霾。