考量敵情威脅與作戰需求，空軍將「防空砲兵指揮部」及「防空飛彈指揮部」2個單位進行整併，9月1日將改編為「空軍防空暨飛彈指揮部」，進一步提升聯合防空的作戰效能。
國防部今天(22日)表示，「防空砲兵指揮部」跟「防空飛彈指揮部」，各自擁有的防空武器系統獨特且複雜度高，個別的防空陣地分佈廣闊、幅員過大，整併之後，可以有效整合、運用防空飛彈戰力，擔負聯合防空作戰任務，並使防空作戰指管事權統一，不僅增加作戰指揮速度與兵力運用彈性，也能發揮整體防空作戰效能。
國防部進一步表示，「空軍防空暨飛彈指揮部」規劃指揮官以「中將」編設，以擔負防空部隊政策、教育訓練、後勤整備以及建軍規畫等工作，原防砲及飛彈群級單位整併後，透過「交織歷練」，以增加中、高階管理幹部的歷練，健全人事發展。
國防部強調，「防空暨飛彈指揮部」編成的目的，在於統一防空作戰指管事權，並加快威脅反應速度，以建立一支「量適、質精、戰力強」之防空勁旅。