教育部退回台大校長聘任案，引發不少台大師生抨擊教育部是違法亂政，不過，也有台大老師持不同看法，認為台大並非台大人自己的，而是國家的資產、是全民的台大，所以教育部依法是有相關權限，做出這次的決議。

教育部歷經3個多月的研議，決定駁回台大校長當選人管中閔聘任案，引發爭議，由台大師生組成的台大自主行動聯盟，已號召台大人在4日下午靜坐及罷課。不過，也有台大老師認為，教育部是有相關權限可做出這樣的決議，在法律上沒有問題。
台大法律學系特聘教授顏厥安指出，台大每年的運作經費達新台幣100多億，其中，有60、70億是政府給的，且台大所有的校產都是國有財產，所以台大並不是台大人自己的，台大是國家的資產；台大校長也不是台大人的校長，而是受到全民委託來管理這所大學，因此，教育部基於本身的公共任務及高等教育發展的職責，有權監督學校。
顏厥安表示，也許大家對教育部這次決議的判斷內容，會有不同意見，但本來很多事情都是見仁見智，包括校長遴選委員會的判斷也是見仁見智，不能說遴委會做出的結論都一定對。顏厥安：『(原音)何況遴委會疏忽了一些重要的事情，教育部本於他的職責，在他的意見書裡面好像都有寫吧，但是你不能說這個判斷是不對的，是只有遴委會的判斷是對的，不能夠這樣子。』
對於台大校長遴選委員會有意不再重啟遴選作業程序，顏厥安說，遴委會現在不開會又不解散，他不知道要幹嘛，讓整個狀態變得很奇怪。