台北地檢署偵辦台大校長遴選案，以電話個別約談遴選委員，未採取書面通知，遭批評是「比白色恐怖更恐怖」。對此，也是遴選委員之一的教育部次長姚立德今天(23日)表示，幾週前，他也是接到檢察官直接打電話給他，請他和人事處長到指定地點說明校長遴選細節，他沒有覺得不妥，原則上尊重司法程序。
台北地檢署也發布新聞稿說明，因有證人主動要求希望不要曝光，所以由檢察官親自以電話與證人聯繫，待證人依時到庭時，檢察官均會依法辦理相關程序，這也是北檢偵辦案件保持偵查不公開的例行方法；而大多數證人對檢察官以此方式保護證人隱私，均表示感謝與支持，未聽聞有人持有不同意見。
另外，台大在5月12日召開臨時校務會議，決議要求教育部依法儘速發聘管中閔為台大校長，並將會議結果函文教育部。對此，姚立德表示，教育部已收到來函，由於內容很多，教育部會在仔細審視後，妥善給予回函，若台大想採取行政救濟，教育部都尊重司法程序。