國立台灣大學校長遴選案爭論不休，中央研究院前院長李遠哲今天(20日)表示，遴選案的焦點現在被看成是政治對學術自由的干預，這是完全不對的；日前還有媒體將台大校長候選人，區分為「中研院派」及「台大派」，對某些候選人做不利的連結，進而打擊這些人，後來管中閔被拉上來，前面的人被拉下去，這裡面有很不好的因素在操作。
李遠哲認為，台大最近幾十年進步很少，沒有能力找一流的校長。他提到，國立清華大學第一次進行校長遴選時，他擔任遴選委員會召集人，當時他們做了很多努力，透過遴選會的「自我教育」，認清清華大學的需求，後來遴選出國外很有名的教授擔任校長，大家都非常興奮，所以台大如果做不到這樣的事，本身要檢討。
李遠哲強調，國外大學的校長遴選若沒有成功，遴選會要馬上解散，重新組織、重新開始，現在台大校長遴選案被誤導成政府插手學術自由，這是完全不對的事。