受檢察官高度關注的一、二審檢察官輪調新制拍板定案，未來「新二審」的檢察官任期以3年為限，3年屆滿須輪調一審，至於現任的二審檢察官，則並未強迫回歸一審，引發「萬年二審」的批評。對此，法務部長邱太三今天(16日)表示，檢察人力的配置應該適才適所，會再研究相關配套，讓二審檢察官願意調到一審，沒有所謂「萬年二審」的問題。

法務部日前新頒布的一、二審檢察官輪調制度規定，未來「新二審」的檢察官任期以3年為限，3年屆滿須輪調一審，表現優異者，得優先遴任檢察長等要職，但現任的二審檢察官，法務部並未強迫回歸一審。對此，由基層檢察官組成的「劍青檢改」批評法務部「保護萬年二審」，甚至擔憂「輪調新制」造成一、二審間仇恨與對立。
立法院司法法制委員會16日邀請法務部針對「如何增進司法程序的效率及一、二審檢察官輪調制度」進行專案報告。法務部長邱太三在接受國民黨立委吳志揚質詢時表示，對於基層的憂慮，法務部會審慎處理，會讓檢察人力配置適才適所。邱太三說：『(原音)沒有所謂萬年二審的問題，我們檢察的人力要怎麼配置讓他適才適所。我們剛才提到的，第二個，二審的年紀大的我們把他硬調下來，他反而不能勝任，他要出去外勤，他要所謂值班，如果不能做，這樣會比較好嗎？我們會研究相關配套，讓他能夠下來，適任、而且願意勝任、也能夠勝任。』
時代力量立委黃國昌則追問，對於基層檢察官的反彈，法務部是否會將「輪調新制」退回？邱太三則說，這只是初期的方案，會再研擬相關配套，但他不同意退回，法務部也做Q&A來回應基層檢察官的疑問。
法務部在報告中則指出，由於一、二審檢察官對於「輪調新制」見解歧見甚大，為避免衝擊過大，造成一、二審對立，法務部會研擬一套可長可久的制度，司法院目前也積極推動審判系統金字塔化，待該制度修正後，就可搭配二審蒞庭檢察官所需人數及其業務狀況，適度從二審撥補人力至一審檢察官。因此，目前新二審採職期制，舊二審則採自願制。