深澳燃煤電廠引發爭議，國際空污專家估算，深澳電廠運轉後每年所產生的空氣污染物，等於160萬輛小客車的排放總量，大幅增加北台灣民眾的健康風險。專家並指出，即使深澳電廠使用高效率的燃煤機組，其污染排放仍遠高於燃氣電廠。

深澳燃煤電廠更新擴建案引發環保爭議，環保組織綠色和平18日邀請國際空氣污染分析師勞里‧麋偉(Lauri Myllyvirta)發表其對深澳電廠的分析報告。
勞里是芬蘭政府出席 2005年聯合國氣候變遷綱要公約第 11 屆締約國大會的代表團成員之一，根據他的估算，未來深澳電廠每年將排放600萬噸二氧化碳、1,155噸二氧化硫、830噸氮氧化物、218噸懸浮微粒，等於是160萬輛小客車的污染排放總量，大幅增加北台灣民眾的健康風險。勞里：『(原音＋翻譯)在台電自提的模式中，這樣的排放量會造成PM2.5、NO2、臭氧這些污染物的濃度提升，所以他評估會影響到6個縣市1,000多萬的人口，也會造成每年數十人提早死亡。』
對於所謂「乾淨的媒」的說法，勞里則認為是「誤導民眾」的詞彙。他表示，政府說深澳燃煤電廠的污染排放接近燃氣電廠，那只是拿高效率燃煤電廠跟低效率燃氣電廠比，若都以高效率機組相較，硫氧化物的排放燃煤是燃氣的15倍、氮氧化物是1.7倍、懸浮微粒是4倍、重金屬汞是12倍。勞里：『(原音＋翻譯)如果把深澳發電廠的排放量，跟有同樣污染防治措施的天燃氣發電廠排放量比的話，他的污染物排放會是有倍數的差距，所以政府這樣的說法是相當不正確的。』
勞里指出，淘汰燃煤電廠已經是先進國家趨勢，歐盟27國中有6國已經淘汰燃煤，還有11國會在2030年淘汰；包括日本、美國、印度、德國、中國等，在燃煤發電及再生能源發展上，都已經面臨黃金交叉階段，台灣既然已經設定2025年再生能源比例達20%，就應該投入更多資源發展彈性調度，而不是再蓋一座不利電力調度的燃煤電廠。