潛艦國造遭質疑「黑箱作業」，有媒體報導，負責潛艦設計的台船公司，委託不知名的公司當技術顧問，甚至還未以公開招標方式執行，立委質疑恐成為下一個「慶富案」。對此，海軍司令部今天(1日) 傍晚表示，報導內容與事實不符。
海軍司令部指出，潛艦國造第一階段合約設計由台船公司招標，有7家國外公司競標，經台船針對每家競標公司資本、技術人員、輸出許可等條件進行反向查證，僅有GL公司具備輸出許可條件，台船公司依「政府採購法」採限制性招標，經歷3次開標，由GL公司以新台幣6億餘元得標。
海軍司令部強調，潛艦國造採購案完全由主合約商台船公司與原廠直接接觸，避免掮客與代理商介入，各項商源均由潛艦人員、中科院、台船及國內學者，專案共同審查與管控，均依法行政，杜絕任何違法弊端發生。
海軍司令部說，本案目前進度正常，絕無黑箱作業，各項期程進度，均依工作節點推進，且有案可稽，目前已有初步成果，請國人支持。