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有媒體報導指出，海軍計畫建造新一代巡防艦，原型艦要在2026年底以前完工交艦，但建造進度卻出現重大變數，新一代巡防艦原型艦的預算金額，原訂在明年度要編列新台幣46億9,316萬9千元的預算，但卻僅編列9,051萬5千元，大幅縮減46億之多，顯示造艦與重要國造系統研發進度出現問題。
對此，海軍司令部今天發出新聞稿(13日)表示，基於「國艦國造」政策，新一代巡防艦原型艦建造案委由中科院研製；但因中科院迅聯科研案進度延緩1年，因此，109年度(2020年)預算同步緩列至110年(2021年)執行。
另外，針對媒體報導指出，新一代巡防艦原型艦的建造進度，若受中科院相關系統研發進度不如預期的影響，將立即啟動備案，改採與國外知名大廠合作。海軍司令部表示，一切純屬臆測，新一代巡防艦原型艦的建造仍以中科院科研案為主，國外廠商備案為輔，軍方將會審慎作整體評估，以符合作戰實需。
軍方強調，因應現代戰場環境與敵情威脅，中科院刻正依海軍作戰需求完成科研案；海軍也將嚴格檢核中科院研發及測評工作進度，依計畫如期完成本案籌建目標。
