環保團體認為，台灣垃圾回收率高是因部分垃圾未記載在環保統計年報中，垃圾回收率的定義模糊不清。行政院環境保護署回應，有部分垃圾是非經常性的，數字調整後就會與報表有差距。
華爾街日報2016年報導，台灣垃圾回收率高達55%，遠高於歐美其他國家，是垃圾處理的天才。環保團體看守台灣協會今天在台灣大學舉行「揭開垃圾處理天才的真相！」座談會，談論台灣垃圾回收率問題。
看守台灣協會秘書長謝和霖表示，近年台灣垃圾產生量持平，在垃圾回收量增加、清運量減少的情況下，乍看好像回收率一直提高，但實際上環保統計年報中的垃圾清運量，卻只有涵蓋清潔隊收取部分，許多民營業者清除的大宗垃圾並沒有算在統計年報內，拿統計年報與焚化爐營運紀錄相比，誤差每年近100萬噸。
此外，謝和霖指出，2013至2015年焚化爐營運紀錄也顯示，每年收到的一般事業廢棄物約有220萬噸，但環保署掌握到的只有70至86萬噸，其中還包含36%至46%的員工生活垃圾，無法掌握的100多萬噸則包含公寓大廈生活垃圾、市場或小工廠廢棄物等與生活垃圾無異的廢棄物，卻因為是由民間清除業者直接送到焚化爐，而被某些縣市排除在清運量之外。
除了部分家戶垃圾不被列入清運量外，謝和霖說，地方環保局也會請列管社區和機關申報資源回收量，隨著列管社區逐漸增加，回收量逐年增加、一般垃圾清運量減少，垃圾回收率就這樣輕鬆提高，亮眼數字背後其實是龐大的垃圾處理問題。
謝和霖因此認為，垃圾回收率指標是用來反映垃圾的真實情況並找出問題、解決問題，而非美化現實，呼籲地方政府應確實盤點回收黑洞，掌握並建立足夠、多元和因地制宜的處理量能。
對此，環保署廢管處處長賴瑩瑩受訪指出，垃圾在進焚化場時，都會分為事業廢棄物及一般廢棄物，由於有部分一般廢棄物是非經常性的，像是風災、災變等產生的廢棄物，這些都不算在家戶垃圾中，因此將數字調整後就會與報表有差距。
賴瑩瑩表示，環保署會持續推動垃圾源頭減量，也有部分縣市正在推動多元化的垃圾處理計畫。