有媒體披露促轉會副主委張天欽在8月24日主持的內部會議內容，顯示要針對國民黨新北市長參選人侯友宜進行政治操作。
對此，總統府12日上午發表聲明，表示轉型正義的落實是國家在民主鞏固、深化過程中最重要的基礎工程，更是國人所高度期待。相關工作的推動並非針對個人，也無關政黨間的傾軋競爭，過程中確保獨立客觀的態度更是關鍵。
總統府指出，對於媒體報導有關人員談話，若為屬實，無論公開或私下都不適當，也傷害了促轉會的公正性與中立性，總統府無法認同。